Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CBFBQ13951 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CBFBQ13951 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CBFBQ13951 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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