Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms