Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4AQ13619 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CUL4AQ13619 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CUL4AQ13619 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CUL4AQ13619 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CUL4AQ13619 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CUL4AQ13619 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CUL4AQ13619 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CUL4AQ13619 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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