Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
EIF4EBP1Q13541 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms