Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms