Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATRQ13535 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATRQ13535 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ATRQ13535 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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