Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TUBB3Q13509 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms