Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GPM6BQ13491 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms