Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMAD4Q13485 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms