Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCOF1Q13428 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCOF1Q13428 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
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