Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms