Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SCGB2A2Q13296 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SCGB2A2Q13296 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SCGB2A2Q13296 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SCGB2A2Q13296 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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SCGB2A2Q13296 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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SCGB2A2Q13296 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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SCGB2A2Q13296 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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SCGB2A2Q13296 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SCGB2A2Q13296 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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