Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms