Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CSTF3Q12996 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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