Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms