Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLFN5Q08AF3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLFN5Q08AF3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms