Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNG1Q06432 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms