Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms