Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTDSPL2Q05D32 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms