Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB3Q05901 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms