Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNC1Q01954 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms