Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2P78314 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms