Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TUBB4BP68371 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms