Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LINC00313P59037 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms