Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms