Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AP1S2P56377 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms