Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSRP3P50461 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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