Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms