Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms