Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PBX2P40425 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PBX2P40425 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PBX2P40425 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PBX2P40425 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PBX2P40425 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBX2P40425 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBX2P40425 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBX2P40425 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBX2P40425 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBX2P40425 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBX2P40425 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBX2P40425 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBX2P40425 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBX2P40425 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBX2P40425 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBX2P40425 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBX2P40425 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBX2P40425 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBX2P40425 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBX2P40425 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBX2P40425 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms