Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms