Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms