Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXD12P35452 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms