Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2H1P32780 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms