Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFNP31947 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFNP31947 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms