Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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TSPOP30536 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TSPOP30536 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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