Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5DP30049 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms