Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CASP1P29466 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms