Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PEX2P28328 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEX2P28328 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms