Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNMT1P26358 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms