Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF1BP20333 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms