Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LBPP18428 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LBPP18428 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LBPP18428 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LBPP18428 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms