Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms