Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODC1P11926 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODC1P11926 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODC1P11926 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODC1P11926 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODC1P11926 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODC1P11926 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODC1P11926 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODC1P11926 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms