Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms