Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHGAP10645 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHGAP10645 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms