Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms