Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHOP08100 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms