Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB1P08034 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB1P08034 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms