Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA4FO95754 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms